V případě úmrtí podléhají emise Dluhopisu Republiky, stejně jako všechny jiné cenné papíry, dědickému řízení, přičemž do doby ukončení pozůstalostního řízení jsou dluhopisy ponechány na majetkovém účtu zesnulého, kde jsou dále úročeny.

Na základě ukončeného pozůstalostního řízení je samotné provedení přechodu státních dluhopisů z majetkového účtu zesnulého na majetkový účet dědice realizováno podáním Žádosti o přechod státních dluhopisů na jedné z vybraných poboček smluvních distributorů, které poskytují navazující služby k emisím určeným pro občany. Žádost je možné podat pouze osobně na těchto pobočkách. V návaznosti na sepsání výše uvedené žádosti jsou předmětné dluhopisy převáděny na majetkový účet dědice, přičemž je nutné u smluvního distributora prokázat dědický nárok. Pokud dědic nemá dosud veden majetkový účet v samostatné evidenci státních dluhopisů vedené Ministerstvem financí, bude mu na základě této žádosti zřízen. 

Jmenovitá hodnota včetně případného posledního výnosu jsou k datu splacení vyplaceny na platební účet vlastníka dluhopisů evidovaný v samostatné evidenci státních dluhopisů a dědickému řízení podléhají tyto peněžní prostředky. Je-li tento platební účet blokován, peněžní prostředky jsou vráceny zpět na účet Ministerstva financí a dědic o jejich vyplacení může po prokázání svého nároku požádat prostřednictvím Žádosti o provedení reklamace nevyplacení výnosu nebo nesplacení jmenovité hodnoty. 

V případě Flexi bondu (Vyměnitelné státní pokladniční poukázky) je v případě úmrtí vlastníka po obdržení referenčního údaje z registru obyvatel nebo po pokynu oprávněné osoby ukončena automatická výměna do nového dluhopisu a příslušný dluhopis je automaticky splacen společně s vyplacením výnosu na platební účet vlastníka dluhopisů evidovaný v samostatné evidenci státních dluhopisů a dále je postupováno, jak je popsáno v předchozí větě.